La prueba de secuenciación metagenómica de próxima generación desarrollada en la UCSF demuestra su eficacia para diagnosticar rápidamente casi cualquier tipo de patógeno.
Una prueba genómica desarrollada en la Universidad de California en San Francisco para detectar rápidamente casi cualquier tipo de patógeno (virus, bacteria, hongo o parásito) ha demostrado ser exitosa después de una década de uso.
La prueba tiene el potencial de mejorar enormemente la atención de las infecciones neurológicas que causan enfermedades como la meningitis y la encefalitis, así como de acelerar la detección de nuevas amenazas pandémicas virales. Utiliza una poderosa técnica de secuenciación genómica, llamada secuenciación metagenómica de próxima generación (mNGS).
En lugar de buscar un tipo de patógeno a la vez, mNGS analiza todos los ácidos nucleicos, ARN y ADN, que están presentes en una muestra.
Una foto de la cabeza de Charles Chiu.
“Nuestro objetivo era completar todo el proceso en un plazo de 12 a 24 horas, ofreciendo un resultado el mismo día o al día siguiente”.
Dr. Charles Chiu, doctor en medicina
“Nuestra tecnología es engañosamente simple”, dijo Charles Chiu , MD, PhD, profesor de medicina de laboratorio y enfermedades infecciosas en la UCSF y autor principal del estudio. “Al reemplazar múltiples pruebas con una sola prueba, podemos eliminar las largas conjeturas a la hora de diagnosticar y tratar las infecciones”.
Los investigadores desarrollaron originalmente una prueba clínica mNGS para analizar el líquido cefalorraquídeo (LCR), el líquido prístino que baña el cerebro y la médula espinal.
La prueba ya se ha realizado en miles de pacientes con síntomas neurológicos inexplicables, tanto en la UCSF como en otros hospitales de todo el país.
En un artículo que aparece el 12 de noviembre en Nature Medicine , el equipo demostró que la prueba mNGS identificó correctamente el 86% de las infecciones neurológicas.
En un estudio complementario publicado el mismo día en Nature Communications , el equipo también utilizó mNGS para identificar patógenos en el líquido respiratorio que pueden causar neumonía y lo automatizó para obtener resultados más rápido.
Esperan que la prueba automatizada pueda detectar nuevos patógenos virales que podrían causar pandemias respiratorias como COVID-19.